Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
U2AF1L5P0DN76 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms