Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM200BP0CF97 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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