Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB7P09629 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms