Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SRPRAP08240 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms