Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSLP07711 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSLP07711 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSLP07711 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSLP07711 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSLP07711 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSLP07711 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSLP07711 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSLP07711 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSLP07711 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSLP07711 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSLP07711 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSLP07711 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSLP07711 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSLP07711 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSLP07711 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSLP07711 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSLP07711 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSLP07711 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSLP07711 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSLP07711 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSLP07711 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSLP07711 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSLP07711 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSLP07711 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTSLP07711 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSLP07711 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSLP07711 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSLP07711 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSLP07711 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSLP07711 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSLP07711 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSLP07711 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSLP07711 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSLP07711 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSLP07711 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSLP07711 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSLP07711 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSLP07711 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSLP07711 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSLP07711 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSLP07711 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSLP07711 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSLP07711 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTSLP07711 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSLP07711 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSLP07711 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSLP07711 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSLP07711 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSLP07711 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSLP07711 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSLP07711 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSLP07711 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSLP07711 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSLP07711 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSLP07711 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSLP07711 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSLP07711 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSLP07711 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSLP07711 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSLP07711 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSLP07711 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTSLP07711 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTSLP07711 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTSLP07711 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTSLP07711 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTSLP07711 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTSLP07711 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTSLP07711 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTSLP07711 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTSLP07711 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CTSLP07711 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTSLP07711 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTSLP07711 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSLP07711 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSLP07711 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSLP07711 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSLP07711 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSLP07711 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSLP07711 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSLP07711 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSLP07711 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSLP07711 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSLP07711 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSLP07711 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSLP07711 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSLP07711 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSLP07711 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSLP07711 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSLP07711 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSLP07711 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSLP07711 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSLP07711 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSLP07711 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSLP07711 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSLP07711 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSLP07711 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSLP07711 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSLP07711 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTSLP07711 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms