Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPHP4O75161 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms