Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CYTIPO60759 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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CYTIPO60759 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTIPO60759 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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