Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 DNM3-208ENST00000627582 7625 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 BCORL1-205ENST00000540052 7127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
NDUFS5O43920 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms