Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HOXA3O43365 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HOXA3O43365 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms