Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLOCKO15516 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLOCKO15516 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms