Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTDSP2O14595 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms