Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QRK9 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
J3QRK9 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
J3QRK9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
J3QRK9 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
J3QRK9 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
J3QRK9 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
J3QRK9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
J3QRK9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
J3QRK9 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
J3QRK9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
J3QRK9 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
J3QRK9 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QRK9 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QRK9 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QRK9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QRK9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QRK9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QRK9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QRK9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QRK9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QRK9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QRK9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QRK9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QRK9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QRK9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
J3QRK9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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