Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01387J3KSC0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms