Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVV-2B6SEH9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVV-2B6SEH9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms