Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GOLGA6L4A6NEF3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms