Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
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