Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPR55Q9Y2T6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms