Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM5BQ9UGL1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5BQ9UGL1 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms