Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VPS45Q9NRW7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms