Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM4Q9C037 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms