Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms