Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
HIGD2AQ9BW72 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms