Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNS3Q9BQ31 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNS3Q9BQ31 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNS3Q9BQ31 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNS3Q9BQ31 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNS3Q9BQ31 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNS3Q9BQ31 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNS3Q9BQ31 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms