Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TCF12Q99081 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TCF12Q99081 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms