Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RPS6KC1Q96S38 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms