Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDK5RAP3Q96JB5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms