Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TM4SF18Q96CE8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms