Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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GTF3C6Q969F1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
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GTF3C6Q969F1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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GTF3C6Q969F1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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GTF3C6Q969F1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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GTF3C6Q969F1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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GTF3C6Q969F1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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GTF3C6Q969F1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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GTF3C6Q969F1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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GTF3C6Q969F1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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