Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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RNF182Q8N6D2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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RNF182Q8N6D2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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RNF182Q8N6D2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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RNF182Q8N6D2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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RNF182Q8N6D2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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RNF182Q8N6D2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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RNF182Q8N6D2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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RNF182Q8N6D2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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RNF182Q8N6D2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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RNF182Q8N6D2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF182Q8N6D2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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