Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC117Q8IWD4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms