Protein–RNA interactions for Protein: Q86X40

LRRC28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC28Q86X40 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC28Q86X40 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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