Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms