Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
STRADAQ7RTN6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms