Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
WDR88Q6ZMY6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR88Q6ZMY6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR88Q6ZMY6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR88Q6ZMY6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR88Q6ZMY6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR88Q6ZMY6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR88Q6ZMY6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR88Q6ZMY6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR88Q6ZMY6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR88Q6ZMY6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR88Q6ZMY6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
WDR88Q6ZMY6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms