Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCD1Q6ZMY3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms