Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms