Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GARNL3Q5VVW2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GARNL3Q5VVW2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms