Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC38Q5VT99 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRC38Q5VT99 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRC38Q5VT99 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRC38Q5VT99 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRC38Q5VT99 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC38Q5VT99 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC38Q5VT99 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC38Q5VT99 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC38Q5VT99 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC38Q5VT99 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC38Q5VT99 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC38Q5VT99 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms