Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
WASHC2DQ5SRD0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms