Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESCO2Q56NI9 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms