Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMA3Q16787 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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