Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2B3Q16720 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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