Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
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