Protein–RNA interactions for Protein: Q16643

DBN1, Drebrin, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBN1Q16643 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DBN1Q16643 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms