Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
E2F4Q16254 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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