Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
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