Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCN9AQ15858 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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