Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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