Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK13Q14004 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms