Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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